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南方医科大学司法鉴定中心是经广东省司法厅核准成立的大型法医类司法鉴定机构，是广东省最具影响力的权威司法鉴定机构之一。中心隶属于南方医科大学，以法医学系为依托，开展法医病理、法医临床、法医物证、法医毒物和微量物证等五个门类的司法鉴定业务。法医学学科带头人、留德博士、法医学病理学专家王慧君教授自1999年负责法医学学科建设以来，依托学校的良好条件，奋力建设法医学科。在她的领导下，先后建立了法医学教研室暨法医学研究所，南方医科大学司法鉴定中心和法医学系，发展、开拓了法医学教学、科研和鉴定工作。中心建筑面积4000余平方米，拥有国内一流的法医门诊部和各类司法鉴定实验室，包括法医病理实验室、DNA（亲子鉴定）实验室、法医毒物检测实验室、法医临床诱发电位及肌电图检查室，以及一大批先进的大型仪器检测设备，包括ABI3130xl遗传分析仪、API4000Qtrap高效液相色谱与质谱联用系统和XSeriesⅡ型电感耦合等离子体质谱仪等。“路漫漫其修远兮”，我们朝气蓬勃、锐意进取、精诚团结、勇于创新，我们无比热爱我们的事业，我们也将培养更多的法医专业人才，为国家稳定和社会发展做出新的贡献。
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