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医院占地面积145亩（东院131亩、西院14.1亩）；建筑面积：185744m2（东院147443.9m2、西院38299.8m2）；核定床位1300张（东院1000张、西院300张）；实际开放床位1600余张。全院在编人员2651人，卫技人员2196人。医院医疗技术力量雄厚，拥有在职正高职称专家122名，副高职称专家289名，据较新统计资料，年收治门急诊病员近217万余人次，住院病人逾5万7千人次，完成各类手术2.8万余台。医院拥有立体定向下微电极刺激仪（细胞刀）、超声刀、核磁共振仪（MRI）、多层螺旋CT（MSCT）、数字X线摄片机（DR）、PET-CT、肿瘤放疗设备、数字减影心血管造影系统（DSA）、单光子发射计算机断层检查仪（SPECT）、彩色Doppler诊断仪、流式细胞仪、大型生化分析仪等先进的大型医疗设备。1999年10月，仁济东院建成投入使用，摆脱了长期困扰医院发展的地域限制，医院占地面积由原来的14亩扩大为145亩。床位数由原来的800张增加到1300张。东部进入三期建设快速发展时期：2007年底干部保健综合楼实现结构封顶。建筑面积5.85万平方米的门急诊医技楼经上海市发改委正式批准立项。医院共设临床科室33个，临床医技科室8个，并有国家教育部重点学科、卫生部重点实验室1个（消化内科）、国家教育部重点学科组成单位1个（内科学）；国家教育部重点学科培育学科组成单位1个（神经外科学）；十五“211工程”重点学科（专业）3个（消化内科学、风湿病学、外科学）；上海市重点学科2个（消化疾病学、风湿病学）；上海市教委重点学科2个（风湿病学、妇产科学）；上海市临床医学中心2个（消化疾病、风湿疾病）；上海市医疗质控中心3个（血透、消化内科、激光）；市级研究所3个（消化疾病、风湿疾病、男性疾病）；上海市单一的人类精子库、上海真美妇科疾病研究所、上海市危重孕产妇会诊抢救中心。该院有副主任委员5名；上海市主任委员4名、副主任委员10名；刊物主编1名、副主编9名；地方刊物主编4名、副主编20名。仁济临床医学院设有18个教研室承担临床教学任务，博士学位授予点13个，硕士学位授予点21个，博士研究生导师30名，硕士研究生导师98名。2001，医院在全市三级综合性医院中率先推行并通过ISO9001质量管理认证体系，并每年通过质量认证。
